নলকূপ খননের কাজটি আপাতত দৃষ্টিতে খুব সহজ মনে হলেও কাজটি করার জন্য এ বিষয়ে যথেষ্ট কারিগরি জ্ঞান থাকা প্রয়োজন। নিম্নে স্থান নির্বাচন করার ক্ষেত্রে বিবেচ্য কিছু বিষয়ের উল্লেখ করা হলো :
১. নলকূপ খননের আগে নলকূপের জন্য সুবিধাজনক স্থান নির্বাচন করা অপরিহার্য।
২. পানিয় কাজে হস্তচালিত নলকূপের স্থান নির্বাচনের ক্ষেত্রে যে প্রধান বিষয়গুলো বিবেচনা করতে হয় তা হলো দূষিত পানির উৎস বা পয়ঃনিষ্কাশন নালা হতে দূরে, নলকূপের পানির স্তর যাতে দূষণমূক্ত থাকে এমন স্থানে নলকূপের স্থান নির্বাচন করতে হবে।
৩. কৃষি জমিতে সেচ প্রদানের উদ্দেশ্যে স্থাপিত নলকূপের ক্ষেত্রে নলকূপের স্থান নির্বাচনের জন্য যে জমিতে সেচ দেওয়া হবে তার মধ্যে সবচেয়ে উঁচু জমিতে নলকূপের স্থান নির্বাচন করা প্রয়োজন ।
৪. সেচযোগ্য এলাকার মোটামুটি মধ্যভাগে হলে ভালো এতে সেচের পানি সেচনালা দিয়ে সরবরাহ করতে সুবিধা হয় । তবে এমন স্থানে কোনো উঁচু জমি না পেলে এ বিষয়টি বিবেচনায় আনার প্রয়োজন নেই ।
৫. ইঞ্জিন চালিত পাম্প হলে স্থান নির্বাচনের ক্ষেত্রে কোনো অসুবিধা নেই কিন্তু বিদ্যুৎ চালিত হলে সে ক্ষেত্রে অবশ্যই বৈদ্যুতিক লাইনের কাছাকাছি স্থান নির্বাচন করা প্রয়োজন ।
৬. নলকূপের স্থানটি যে কোনো রাস্তা বিশেষ করে পাকা সড়কের পাশে হলে ভালো হয় । তবে এটা অত্যাবশ্যকীয় নয় ।